Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsph14Q9D3W1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms