Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stag1Q9D3E6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stag1Q9D3E6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms