Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9D2Q3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms