Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E3

4930583I09Rik, RIKEN cDNA 4930583I09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930583I09RikQ9D2E3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930583I09RikQ9D2E3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930583I09RikQ9D2E3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms