Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc6bQ9D289 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Trappc6bQ9D289 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc6bQ9D289 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms