Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Batf3Q9D275 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Batf3Q9D275 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms