Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q5

Serpinb3b, MCG21235, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb3bQ9D1Q5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 233.1 ms