Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc167Q9D162 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms