Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tmem88Q9D0N8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tmem88Q9D0N8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tmem88Q9D0N8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tmem88Q9D0N8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tmem88Q9D0N8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tmem88Q9D0N8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tmem88Q9D0N8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tmem88Q9D0N8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tmem88Q9D0N8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tmem88Q9D0N8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem88Q9D0N8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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