Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mdm1Q9D067 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mdm1Q9D067 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms