Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ5

Hcfc1r1, Host cell factor C1 regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcfc1r1Q9CYQ5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms