Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bud23Q9CY21 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bud23Q9CY21 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bud23Q9CY21 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bud23Q9CY21 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bud23Q9CY21 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bud23Q9CY21 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bud23Q9CY21 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bud23Q9CY21 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
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Bud23Q9CY21 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Bud23Q9CY21 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bud23Q9CY21 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bud23Q9CY21 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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