Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nip7Q9CXK8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nip7Q9CXK8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms