Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prdm5Q9CXE0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prdm5Q9CXE0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms