Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd8Q9CX56 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmd8Q9CX56 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms