Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm8aQ9CWZ3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rbm8aQ9CWZ3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms