Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd12Q9CWU0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tdrd12Q9CWU0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms