Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smyd3Q9CWR2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smyd3Q9CWR2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smyd3Q9CWR2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smyd3Q9CWR2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smyd3Q9CWR2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smyd3Q9CWR2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smyd3Q9CWR2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd3Q9CWR2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd3Q9CWR2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd3Q9CWR2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd3Q9CWR2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd3Q9CWR2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd3Q9CWR2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd3Q9CWR2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd3Q9CWR2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd3Q9CWR2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd3Q9CWR2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd3Q9CWR2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smyd3Q9CWR2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Smyd3Q9CWR2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smyd3Q9CWR2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smyd3Q9CWR2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smyd3Q9CWR2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smyd3Q9CWR2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms