Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Sycp2Q9CUU3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Sycp2Q9CUU3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Sycp2Q9CUU3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms