Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sft2d3Q9CSV6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms