Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gnpda2Q9CRC9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gnpda2Q9CRC9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms