Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB9

Chchd3, MICOS complex subunit Mic19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd3Q9CRB9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chchd3Q9CRB9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chchd3Q9CRB9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms