Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ska2Q9CR46 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ska2Q9CR46 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms