Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tma16Q9CR02 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tma16Q9CR02 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms