Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ykt6Q9CQW1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ykt6Q9CQW1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms