Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nudt21Q9CQF3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudt21Q9CQF3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms