Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sar1bQ9CQC9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sar1bQ9CQC9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms