Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nudcd2Q9CQ48 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms