Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc198Q9CPZ1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc198Q9CPZ1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms