Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf8Q99PV0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms