Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Bco2Q99NF1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bco2Q99NF1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bco2Q99NF1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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