Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b1Q99NB9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sf3b1Q99NB9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms