Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ms4a6cQ99N08 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6cQ99N08 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms