Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ms4a6dQ99N07 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a6dQ99N07 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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