Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gdpd3Q99LY2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gdpd3Q99LY2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms