Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms