Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmp1Q99KU0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms