Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lactb2Q99KR3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lactb2Q99KR3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms