Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN1

Arrdc1, Arrestin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arrdc1Q99KN1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arrdc1Q99KN1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arrdc1Q99KN1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arrdc1Q99KN1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arrdc1Q99KN1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arrdc1Q99KN1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arrdc1Q99KN1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arrdc1Q99KN1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arrdc1Q99KN1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arrdc1Q99KN1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arrdc1Q99KN1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arrdc1Q99KN1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arrdc1Q99KN1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arrdc1Q99KN1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arrdc1Q99KN1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arrdc1Q99KN1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arrdc1Q99KN1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arrdc1Q99KN1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arrdc1Q99KN1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arrdc1Q99KN1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arrdc1Q99KN1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms