Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Reep3Q99KK1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Reep3Q99KK1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms