Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlcd1Q99JT6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tlcd1Q99JT6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlcd1Q99JT6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms