Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ddb2Q99J79 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ddb2Q99J79 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ddb2Q99J79 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ddb2Q99J79 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddb2Q99J79 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ddb2Q99J79 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ddb2Q99J79 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ddb2Q99J79 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Ddb2Q99J79 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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Ddb2Q99J79 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ddb2Q99J79 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ddb2Q99J79 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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