Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim11aQ99J19 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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