Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lmo1Q924W9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Lmo1Q924W9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Lmo1Q924W9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmo1Q924W9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Lmo1Q924W9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Lmo1Q924W9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Lmo1Q924W9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo1Q924W9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo1Q924W9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo1Q924W9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo1Q924W9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo1Q924W9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo1Q924W9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmo1Q924W9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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