Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csmd1Q923L3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms