Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf7Q922B6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf7Q922B6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf7Q922B6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Traf7Q922B6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf7Q922B6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf7Q922B6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf7Q922B6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf7Q922B6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf7Q922B6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf7Q922B6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf7Q922B6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf7Q922B6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf7Q922B6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf7Q922B6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf7Q922B6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf7Q922B6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf7Q922B6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf7Q922B6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf7Q922B6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Traf7Q922B6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Traf7Q922B6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Traf7Q922B6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Traf7Q922B6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Traf7Q922B6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Traf7Q922B6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Traf7Q922B6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Traf7Q922B6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Traf7Q922B6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms