Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TardbpQ921F2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TardbpQ921F2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TardbpQ921F2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms