Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Pde6cQ91ZQ1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Pde6cQ91ZQ1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Pde6cQ91ZQ1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde6cQ91ZQ1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Pde6cQ91ZQ1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Pde6cQ91ZQ1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde6cQ91ZQ1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde6cQ91ZQ1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde6cQ91ZQ1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde6cQ91ZQ1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde6cQ91ZQ1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde6cQ91ZQ1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde6cQ91ZQ1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde6cQ91ZQ1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde6cQ91ZQ1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Pde6cQ91ZQ1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pde6cQ91ZQ1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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