Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms