Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcdhga12Q91XY7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdhga12Q91XY7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms